Con 142 votos a favor y 8 en contra la Convención Constitucional aprobó el protocolo sanitario elaborado por el Colegio Médico, la Sociedad Chilena de Epidemiología y la Sociedad Chilena de Salubridad. Pero el proceso no quedó exento de polémicas, debido a que algunos convencionales, como Arturo Zúñiga, ex subsecretario de redes asistenciales, señalan que nadie está sobre los protocolos nacionales
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En tanto, Elisa Loncon, presidenta de la convención, defendió la decisión:
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El protocolo sanitario establece aforos, espacios y ventilación en el Ex Congreso, que está debidamente señalizado, tanto en español como en lengua de las primeras naciones. Además, los convencionales deberán realizarse dos test de PCR, uno al inicio y otro al término de la semana y se entregará de manera diaria un kit completo con dos mascarillas quirúrgicas o una mascarilla KN95; medidas para reducir la posibilidad de contagios y el correcto funcionamiento de la asamblea.